Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms