Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pprc1Q6NZN1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pprc1Q6NZN1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pprc1Q6NZN1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms