Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga3Q6NZL0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms