Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms