Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms