Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4galnt3Q6L8S8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms