Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm4Q6IRU2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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