Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms