Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6DFW0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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