Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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