Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zfp248Q640N4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zfp248Q640N4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zfp248Q640N4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp248Q640N4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp248Q640N4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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