Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc18Q640L5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
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