Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms