Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vat1Q62465 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms