Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm20854Q62461 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20854Q62461 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20854Q62461 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20854Q62461 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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