Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zpr1Q62384 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zpr1Q62384 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms