Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms