Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn9aQ62205 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn9aQ62205 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms