Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms