Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ttf1Q62187 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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