Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms