Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf1Q61999 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf1Q61999 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf1Q61999 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf1Q61999 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf1Q61999 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms