Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms