Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ifna11Q61716 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ifna11Q61716 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ifna11Q61716 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ifna11Q61716 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifna11Q61716 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ifna11Q61716 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ifna11Q61716 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ifna11Q61716 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ifna11Q61716 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ifna11Q61716 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifna11Q61716 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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