Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift88Q61371 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Ift88Q61371 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift88Q61371 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ift88Q61371 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ift88Q61371 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Ift88Q61371 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift88Q61371 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift88Q61371 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift88Q61371 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift88Q61371 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift88Q61371 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift88Q61371 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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