Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BcanQ61361 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BcanQ61361 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BcanQ61361 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BcanQ61361 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms