Protein–RNA interactions for Protein: Q61180

Scnn1a, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1aQ61180 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scnn1aQ61180 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1aQ61180 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1aQ61180 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms