Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc9a1Q61165 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a1Q61165 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms