Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinQ61043 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinQ61043 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinQ61043 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinQ61043 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinQ61043 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinQ61043 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NinQ61043 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NinQ61043 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NinQ61043 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NinQ61043 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinQ61043 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinQ61043 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NinQ61043 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinQ61043 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinQ61043 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinQ61043 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinQ61043 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinQ61043 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinQ61043 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinQ61043 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms