Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp4Q60972 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms