Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Neurod1Q60867 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms