Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms