Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn2dQ60773 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms