Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp3Q60770 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms