Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a6Q5U4D8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.7 ms