Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NotoQ5TIS6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NotoQ5TIS6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NotoQ5TIS6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NotoQ5TIS6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms