Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms