Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms