Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtp3Q5QGU6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms