Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms