Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms