Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdr39u1Q5M8N4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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