Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD5

Gm21943, Predicted gene, 21943, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21943Q5FWD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21943Q5FWD5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21943Q5FWD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms