Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpm3Q5F4S9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms