Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nlrc3Q5DU56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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