Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms