Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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