Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp13Q5BKP2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms