Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms