Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf109Q499E6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms